Garabateando ideas sobre ciencia, biociencias, metaciencia, información, informática, conocimiento datos e historia

Universidad Nacional Autónoma de México

Layla Michán

Una referencia bibliográfica es la descripción completa y estandarizada de una fuente de información utilizada en un trabajo académico o científico, son los metadatos esenciales rastrear y acceder a un documento o  fuente.

Herramientas para generar referencias

Las disciplinas denomianadas  "ómicas" se utilizan en la investigación en biociencias para comprender mejor la biología de los organismos, la salud humana y las enfermedades, así como para identificar biomarcadores, objetivos terapéuticos y estrategias de diagnóstico más precisas.

Omics y biocolores

Aunque se ha avanzado demasiado en los últimos veinte años para digitalizar la literatura biológico, todavía falta un buen trecho para completar esta tarea. Esta es una lista de artículos que no localizo en formato electrónico y que representará una tarea entretenida, laboriosa e interesante localizar en formato impreso: Baer M (1898) Ueber Bau und Farben der Flügelschuppen bei Tagfalter.

Bibliografía sobre BIOcolores no disponible en formato digital

Siempre he dicho que la ciencia abierta no se expone en conferencia se practica, no se promueve en informes se fomenta, no se escribe se enseña, la ciencia abierta no se dice, se hace. Hacer ciencia abierta es una convicción, un compromiso, una forma de investigar, aquí nuestra contribución.

La ciencia abierta no se dice, se hace

La  investigación digital es un campo multidisciplinario que utiliza herramientas y métodos digitales para recopilar, analizar y interpretar datos. Comprende diversas áreas, como la minería de datos, el análisis de big data y la inteligencia artificial.

Investigación digital en ciencias médicas

Generar recursos de acceso abierto es indispensable para democratizar y difundir el conocimiento científico, para todos, pero no basta que el acceso sea abierto, el recurso debe ser disponible, público, gratuito, accesible, interoperable, reutilizable e inmediato, que permitan la interacción y la colaboración, esto aplica para todos los recursos que se producen en la academia, en especial los educativos, es una responsabilidad social que

Recursos abiertos

Los artículos científicos no solo aportan información sobre el nuevo conocimiento corroborado, también, como parte de los resultados y las discusiones se exponen preguntas que no se han logrado responder. Incluso hay revistas especializadas que publican datos negativos.

Preguntas sin respuesta Biocolores

Ediciones en Wikipedia para Biología del color Esta iniciativa consiste en reunir ideas interesantes para editar entradas de wikipedia para generar contenidos para biología del color con base en las siguientes opciones:Edición Taller/Ciencia coloresTaller/Señales visualesColor en los seres vivosIridocitoCromatóforoReflectinaDavid W. LeeNomenclatura del color de WernerMuestrario de coloresComportamiento deimáticoCategorias de

Biocolores Wikipedia: ideas

Siempre he dicho que usar la información digital y procesarla por medio de  informática es un super poder, cada vez que surfeo en la Web encuentro información nueva, interesante y divertida disponible para resolver problemas; a diario, aparecen tecnologías innovadoras, muchas de ellas amigables disponibles para todos. Hoy más que nunca las barreras y los privilegios se desvanecen, es posibles ser autodidacta, independiente y colaborar.

Educación para todos

La investigación digital se centra en el uso de datos, la literatura, la información y las colecciones que la las contienen, así como en los procesos, los procedimiento y los recursos electrónicos involucrados,

La investigación digital las actividades

Estos son ejemplos de las distintas maneras que se puede usar Wikidata con fines académicos.

 Registrar conjuntos de datos

: https://faircookbook.elixir-europe.org/content/recipes/findability/registeringDatasets.html

 Agregar ORCID

: https://www.semanticscholar.org/paper/ORCID-for-Wikidata.-Data-enrichment-for-Seidlmayer-Vo%C3%9F/de915ce50c88677d3b7cbe761b9ee88387926a65

 Realizar análisis cienciométricos con

Usos académicos de Wikidata

La coloración en los seres vivos se obtiene a partir de la combinación de tres mecanismos biológicos: pigmentos, bioluminiscencia y color estructura. Dentro del color estructural, la iridiscencia que se produce los organismos que tienen iridóforos es espectacular por el tipo de coloración destellante resultado de una fisiología a nivel celular compleja, pero muy interesante, vamos allá.

Iridiscencia: niveles de organización y ontologías

Me encanta la fundación Wikimedia, he aprendido mucho de su filosofía, sus reuniones, su dinámica, etc.. Siempre me sorprenden cuando usan herramientas interesantes para comunicarse, tiene una y mil maneras de implementar tecnologías simple, abierta, eficiente y de vanguardia, estas son algunas de las que me llaman más la atención:

Herramientas de Wikimedia

Cuándo exploro la literatura sobre BIOocolores el procedimiento consiste en identificar información relevante para nuestra investigación, me centro en los siguientes aspectos, que van evolucionando conformo descubro nuevos fenónómenos en la literatura que son de interés para las biociencias, respecto a a su contenido biológico, informacional, informático o metacientífico, de tal manera que diseccionó el artículo en distintas dimensiones como las

Nueva variable biocolores: androcromo y ginecromo

El proceso de enseñanza-aprendizaje basado en investigación digital es versátil, dinámico interactivo, flexible y personalizable, permite usar todas las ventajas de la enseñanza en línea, mediada por tecnología y en un ecosistema virtual, de manera sincrónica y asincrónica que permite comunicación constante e intercambio permanente e inmediato de información, usando la información, diferenciando opiniones de hechos, verificando las fuentes de

Materiales educativos para BIOcolores

En mi opinión uno de los grandes problemas que tenemos con la enseñanza en línea actualmente es la reticencia y el miedo que nos genera adoptar la versión digital para enseñanza e investigación de manera activa, permanente y definitiva en la práctica académica cotidiana, estamos lejos de adoptar culturalmente

Trabajo y enseñanza en línea: pandemia vs normalidad

La metaciencia hace referencia a todos aquellos temas interesantes al rededor de la ciencia, también es conocida como "ciencia sobre la ciencia," es un campo de investigación que se dedica a estudiar y analizar el proceso científico en sí mismo para abordar algunos problemas de la ciencia como los siguientes:Identificar malas prácticas en la academia y fomentar las buenas prácticas entre los investigadoresEvaluación de la Metodología: La

Ciencia y Red: Metaciencia

Soy

 Layla

, investigadora en línea, curiosa permanente, profesora virtual, detective de información digital, cazadora de recursos digitales, curadora de colecciones digitales, bióloga de literatura, amante de los datos, surfeadora en la web, tejedora de bases de datos, taxónoma de recursos digitales y biogeek.

Semblanza 3

Las alternativas profesionales en las biociencias son muchas, existe por supuesto la investigación pero en el siglo XXI la era digital ha ampliado y enriquecido las oportunidades,  su elección debe basarse, como en todos los casos, en el talento, preferencias, gustos y posibilidades veamos algunas: InvestigaciónBásicaAplicadaSocialEnseñanzaComunicación SciComGestión de proyectosManejo de informaciónInnovaciónArte

Distintos trabajos que hace un especialista en biociencias

El día de hoy asistí a la sesión de entrenamiento de Graspos sobre

 Citas y su significado, o por qué citamos,

con Silvio  Peroni ( Universidad de Bolonia)  @essepuntato 23 de julio 2024 disponible en https://graspos.eu/training-material.

 Objetivos de entrenamiento:

Citas y su significado, o por qué citamos (Silvio Peroni)

Colaboradores


 Israel Muñoz-Velasco

, Facultad de Ciencias, UNAM

 Thalía Garcés Jurado

, Investigadora Independiente

 Diana Ramírez Álvarez

, Investigadora Independiente

 Tesis de maestría


 Ixchel Vanesa Chávez Guerrero

. Número de cuenta: 302140695. Maestría MADEMS Biología. Tesis: Aprendizaje por indagación digital: competencias y recursos para desarrollar el tema de evolución en el CCH. En proceso.

Equipo BIOinformación 2024

Soy una investigadora interesada en entender la información, la literatura y los datos en biociencias en formato digital, usadas por humanos y computadas por ordenadores. Además de indagar las fuentes, los procesos, las herramientas y la manera en la que se utilizan, me ocupo en detectar la mejor manera de usarlas en el proceso enseñanza-aprendizaje de biólogos, médicos y biomédicos, especialmente a nivel licenciatura y posgrado.

Semblanza 4

Pavoreal

En el artículo de (Ryan, 2021) aparece la siguiente frase “Más tarde, Darwin escribió una carta ahora famosa al botánico Asa Gray y se quejó de que "¡la vista de una pluma en la cola de un pavo real, cada vez que la miro, me enferma!" Ese fue el inicio de la historia de la selección sexual C. Darwin, “Carta 2743 del proyecto de correspondencia de Darwin” (Universidad de Cambridge, 1860). https: //

Pavoreal de colores

Brillo, una de las cualidades asociadas a la coloración en los organismos es el brillo. El brillo se ve como un reflejo similar a un espejo, es un rasgo asociado  a todos los organismos, desde las mariposas hasta ranúnculos, desde peces hasta moscas. La apariencia de los taxones con superficies brillantes está dominada por un destello, un pulso de luz brillante que sólo es visible bajo ángulos específicos de observación e iluminación.

Brillo

La ontogenia es el proceso de desarrollo individual de un organismo, desde su estado inicial como una célula fertilizada hasta su forma madura y funcional. Es una rama de la biología que se centra en el estudio de cómo los organismos crecen y se desarrollan a lo largo de sus vidas.

Cambios de color ontogenético

El problema de la evaluación académica en la actualidad, es que, ha dejado de ser una mera manera de medir el desempeño y dar un seguimiento a los investigadores y se ha convertido en el canon, a tal grado que, la ciencia se a supeditado a los criterios de evaluación, que generalmente son rígidos, limitados y delimitados,  lo que ha restringido, e incluso inhibido drásticamente la

El problema de la evaluación académica

Pollia condensata

es conocida comúnmente como "fruto de joya", es una planta de la familia Commelinaceae que es nativa de ciertas regiones de África tropical y subtropical. Se ha ganado su nombre común debido a los brillantes y vibrantes colores azules que exhiben sus frutos, que a menudo se asemejan a gemas preciosas o piedras preciosas.

Todo sobre Pollia condensata

ID1350

 10 simples acciones que se debieran implementar en mi facultad

Estos son artículos con 10 simples reglas que sería de mucha utilidad en mi institución académica, sería genial leerlas, compartirlas y discutirlas entre la comunidad. Bourne, P. E. (2022). Ten simple rules for good leadership. PLOS Computational Biology, 18(6), e1010133. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010133Manallack, D. T., &amp;

10 simples acciones que se debieran implementar en mi facultad

BIOwikimedia hace referencia a los proyectos de la Fundación Wikimedia que se centran en las biociencias. La Fundación Wikimedia, conocida comúnmente como Wikimedia Foundation, es una organización sin fines de lucro que desempeña un papel fundamental en el mantenimiento y el soporte de proyectos colaborativos en línea, siendo el más conocido de ellos la enciclopedia en línea Wikipedia.

BIOwikimedia

Indexar la bibliografía se refiere a organizar y crear un índice o catálogo de las referencias bibliográficas en una colección utilizadas principalmente se refiere a la indización de revistas académicas de investigación . La indexación de la bibliografía es importante porque facilita a los lectores la búsqueda y localización de las fuentes citadas en el trabajo. Según DRAE es hacer un índice o registrar.

Indexación en bases de datos

La coloración en los organismos generalmente se clasificaba en tres tipos: pigmentos, estructural y bioluminiscente, la interacción de una o la combinación de estos mecanismos bastaba para explicar la coloración y los patrones de color en los seres vivos.

Nuevo conocimiento en biocolores: color líquido en mariposas

Investigación digital: las actividades

Una de mis fuentes preferidas de información Biológica es BHL porque me transporta a la visión que tenía los naturalistas de siglos anteriores, es una fuente histórica cargada de la tecnología más novedosas, reúne libros de interés para la biodiversidad que nacieron impresos y que se han digitalizado con todo cuidado, siguiendo protocolos y estándares internacionales que facilitan la consulta y el procesamiento automático de la información

BHL para biohistoria

Escribir es una de las competencias indispensables para la investigación digital, generar textos claros y coherentes es un habito que se debe fomentar. Para lograrlo hay que planear el escrito y estructurar las oraciones, frases y párrafos acuciosamente usando las palabras adecuadas y los conectores pertinentes, una buena forma de empezar es escribiendo ensayos.

La tesis

Los bots constituyen una herramienta simple pero poderosa en la investigación digital porque automatizan y facilitan la inmediatez, hay tres tipos de bots que me paren útiles para biociencias, los de Twitter, los de Mastodon y los de Wikipedia. Algunos de estos robots difunden información, otros hacen edición y los demás, anotan información.

Bots para biociencias

Visualizaciones dinámicas con cienciometría

En esta entrada reúno aplicaciones que permiten obtener visualizaciones dinámicas de análisis métricos que son interesantes, creativas y en algunos casos

Programas y aplicaciones para hacer cienciometría

Cuando uno hace referencia al término "virtual" puede significar muchas cosas, en la mayoría de los casos se entiende como el uso de videos, videoconferencias y chats, por ejemplo, en nuestro caso, esas solo constituyen herramientas para vernos, hablar y escribirnos, pero nuestro trabajo se centra en acceder, procesar y analizar bioinformación a través de cientos de programas, para ser mas precisa y evitar confusiones detallaré nuestra dinámica

El formato virtual en el Laboratorio de BIOinformación

En el proceso de BIOcuración de información biológica digital es indispensable asegurarse de generar datos y  metadatos que se asocien y describan a los datos, ambos deben ser de estandarizados, de calidad, homogéneos, actualizados e interoperables, y si somos suficientemente ambiciosos, sería ideal que cumplan con condiciones como que sean públicos, y cumplan con los principios FAIR.

Una tarea indispensable en la BIOcuración: normalizar

En junio del 2023 terminamos el primer curso de Ciencia, tecnología y sociedad: La información para la carrera de Física Biomédica de la Facultad de Ciencias de la UNAM en su primera versión.  El Grupo  3062 del semestre versión 2023-2 tuvo 13 alumnos inscritos, tuve el gusto de estar acompañada por las profesoras Paulina Cruz Castañeda y Minerva María Romero Pérez.

Primer curso de ciencia, tecnología y sociedad: La información semestre 2023-2

En algunos países de Europa y en Estados Unidos, en los que los ciudadanos tienen oportunidades, tiempo recursos y la disposición para hacer investigación, es común ver la realización de lo que yo denomino ciencia comunitaria, ciencia activa y dinámica que se hace a través de la colaboración de distintos actores como académicos, estudiantes, bibliotecarios y ciudadanos con un gran impacto social.

Ciencia comunitaria

Les comparto mis notas sobre el Taller: Laboratorio Creativo del 4to encuentro Wikieducación 2023 en el que participamos 19 Wikipedistas el sábado 17 de junio del 2020.

 Lo que SÍ nos gusta

Wikipedia es divertido, interesante y enriquecedorComúnmente encuentras ideas que nunca se me hubieran ocurrido.Siempre hay alguien que piensa distinto.Convivimos muchas generaciones, culturas, visiones del mundo y estilos de pensamientoHay de todoTe

Imagina una mejor Wikipedia

La comunidad de científicos que trabajan con Ciencia del Color usan una etiqueta para identificarse en los distintos canales de comunicación de la Web, de esta manera se reconocer y comparten información. Esta comunidad está conformada por investigadores, estudiantes y personal asociado. De organizan en laboratorio y grupos, publican en revistas y se reúnen en seminarios y congresos.

Investigación en #colsci

En las reuniones, los chats y la web constantemente se comparten las desventajas de la enseñanza en línea, no solo se exponen para que sean consideradas y neutralizarlas o considerarlas áreas de oportunidad para mejorarlas, sino por el contrario, frecuentemente basta una sola para justificar que la enseñanza en línea no funciona, me voy a poner la tarea de registrarlas todas;

Desventajas de la enseñanza en línea

¿Cuál es la mejor manera de reunir todas las revisiones de literatura que traten sobre biología del color? esa es una pregunta que intento resolver desde hace tiempo, he realizado varias pruebas, utilizando Google Scholar, Lens, Zotero y Wikidata, por mencionar algunas de las que probado más frecuentemente. Seguramente pronto haré este proyecto con más detalle, mientras tanto van aquí algunas de mis divagaciones sobre el tema.

Revisiones BIOcolores

El mundo cambio, la biología se transformó, no podemos seguir enseñando como en el siglo XX, las ciencias de la vida del siglo XXI exigen nuevas aproximaciones, implican dominios recientes e incluyen técnicas innovadoras y de vanguardia, es necesario privilegiar la enseñanza enfocada a investigar, plantear preguntas, reconocer los principales métodos de indagación biológica, procesar información y fomentar la comunicación oral y escrita.

Competencias biológicas siglo XXI

Gene Ontology

Si eres biólogo, médico o biomédico y no conoces Gene Ontology es momento de hacerlo!!! 🧬Para investigación 🧬Para enseñanza 🧬Para consultar bibliografía 🧬Para hacer anotaciones 🧬Es una de las herramientas más importantes de la Biología actual sin la menor duda 🧬Es un buen ejemplo para abordar temas como E-ciencia, integración de conocimiento, multidisciplina, colaboración internacional, normalización, interoperabilidad,

Gene ontology en la literatura de biociencias

Cada vez que asisto al médico, ya sea por primera vez o a una cita recurrente, intercambiamos mucha información, en especial en la primera visita que llena un expediente histórico exhaustivo, largo, repetitivo y no siempre tengo los detalles frescos de todo lo relevante en la memoria, evidentemente estoy pensando en generar un registro médico personal electrónico para reunir toda esta información, que pueda tener organizado y archivado, pero me

Mi registro médico en línea

El color es una cualidad muy utilizada para describir entidades biológicas, es muy útil para identificar organismos, es indispensable para determinar taxones, se aplica para establecer el dimorfismo sexual, e incluso es utilizada para definir especies, de tal manera que, es necesario contar con esquemas de color que permitan normalizar la asignación de colores.

Color Charts

No es común que en las BIOciencias se recupere información en español, generalmente las búsquedas se hacen en inglés y en bases de datos que privilegian este idioma, pero existe una rica investigación en español publicada en revistas de calidad en su inmensa mayoría en acceso abierto (diamante) e indexada en descubridores amigables, veamos algunos que vale la pena consultar constantemente y nutrir con nuestras publicaciones para leer y disfrutar

Buscar literatura académica en español

Qué se ha investigado sobre coloración de las mariposas, cuáles son la publicaciones, los especialistas, temas, variables, fenómenos, taxones, métodos, fuentes, colecciones y regiones y enfoques que se han utilizado históricamente?

Biología del color y mariposas: BIOinvestigación digital

Una de las herramientas que más utilizo para manejar mi información son los RSS porque constituyen una tecnología amigable, simple eficiente e inmediata. Con este recurso puede obtener en tiempo real mediante archivos XML y un lector de feeds  en un solo lugar información sobre distintas fuentes. Adelante escribiré algunos tips y detalles respecto a cómo los uso.

Mis RSS

Manejar la información académica institucional en la Web es todo un reto, porque para que sea aprovechable debe ser interoperable, normalizada y versátil, pues debe cumplir una gran cantidad de propósitos como alimentar informes, generar curriculums vitae, producir indicadores, facilitar las evaluaciones y fomentar las buenas prácticas a nivel internacional.

Perfiles útiles para investigación

Siempre sabemos lo que ha salido bien de una investigación, no obstante, conocer lo que no ha salido bien puede resultar muy constructivo, porque permite evitar los errores. ¿Cuales fuentes de información hay en línea sobre experimentos fallidos, proyectos infructuosos o investigaciones que ha fracasado?

investigaciones fallidas

Las herramientas digitales son aplicaciones, software, plataformas y recursos tecnológicos que se utilizan en entornos digitales para realizar una variedad de tareas, funciones y procesos. Estas herramientas aprovechan la tecnología informática y la conectividad a Internet para facilitar diversas actividades en campos como la comunicación, la productividad, la educación, la colaboración, el entretenimiento y mucho más.

Clasificación de las herramientas para investigación digital

Experimento de enseñanza de la biología: Coloración y visión del color


 Enseñar ciencias haciendo ciencia, indagando información, respondiendo preguntas y resolviendo problemas

El color es una de las características visuales más fascinantes y poderosas del mundo que nos rodea.

Coloración y visión del color: enseñanza innovativa

Un tema que parece simple y cotidiano, que pudiera pasar desapercibido, pero que puede ser sumamente interesantes interesante es la evolución del tamaño de los libros. La historia del tamaño de los libros es fascinante y está marcada por la evolución de la escritura, los sostenes, la impresión, las preferencias culturales y el desarrollo tecnología  a lo largo del tiempo

Los libros de historia natural y biología

Una API, o Interfaz de Programación de Aplicaciones (por sus siglas en inglés, Application Programming Interface), es un conjunto de reglas y protocolos que permiten que diferentes aplicaciones o sistemas informáticos se comuniquen entre sí. En otras palabras, una API define los métodos y datos que las aplicaciones pueden utilizar para interactuar unas con otras de manera estandarizada y predecible.

APIs

Hypothes.is http://hypothes.is/ es un marcador y anotador de páginas web y pdfs, social, semántico que facilita el entendimiento de la información, la discusión y la generación de nuevas ideas. Es un proyecto de software de código abierto 501 (c) que tiene como objetivo recopilar comentarios sobre declaraciones hechas en cualquier contenido accesible en la web, filtrar y clasificarlos.

Hypothes.is para investigación digital

No hay mucha investigación biológica sobre la coloración de las jirafas, lo que sabemos hasta ahora sobre el patrón de coloración de las jirafas.

Las manchas de la jirafa

Mi tarea cotidiana se centra en descubrir información  en línea que comúnmente versa sobre los temas de ciencia, biociencias, metaciencia, informática, información, análisis métricos, semántica, Wikidata y sobre biología del color que posteriormente deberé seleccionar, validar, curar, estructurar, clasificar y enriquecer, procesar, analizar, contextualizar y compartir.

Mis fuentes de información para investigación digital

Una de las fuentes de información sobre los productos académicos son los perfiles de investigación como ORCID, Google Académico, etc.. Tengo algunas dudas sobre la interoperabilidad, estándares y metadatos usando esta plataforma las escribo abajo. ¿En qué formatos se puede exportar la información de ORCID hacía otras plataformas, es posible hacerlo?¿Cómo se debe reportar una patente?¿Cómo se pueden añadir los perfiles en las páginas Web?

Dudas sobre el manejo de perfiles académicos

En los estudios biológicos sobre el color en los seres vivos tiene un sesgo, en muchos casos se describe la función de color desde la perspectiva humana, y esto es incorrecto. Es necesario estudiar e interpretar la coloración y la visión del color desde la perspectiva de los animales, cómo lo ven ellos, cuál es su contexto. Esta podría ser una variable interesante para agregar al análisis de la información sobre biología del color.

Visión del color enfoque antropocéntrico vs zoocéntrico

Cuando se empieza un curso o entrenamiento primero es importante hacer un diagnóstico para identificar las debilidades, las fortalezas y las áreas de oportunidad, este es un test que utilizo en las clases para evaluar el conocimiento sobre los conceptos, métodos y herramientas más relevantes de la investigación digital, al final los resultados se comparan con la checklist de los contenidos del curso.

Test de investigación digital

Dentro de la Biología del color se han publicado interesantes artículos que tratan exclusivamente sobre un color en los seres vivos, estoy resultan interesantes por que se centran en los diversos temas al rededor de un solo tono, veamos algunos a continuación.   Blanco Igic, B., D’Alba, L., &amp; Shawkey, M. D. (2018). Fifty shades of white: How white feather brightness differs among species. The Science of Nature, 105(3), 18.

Publicaciones sobre un solo color

La ciencia es genial, es una profesión divertida, apasionante y libre, siempre y cuando libres algunos de sus obstáculos más comunes, veamos algunos Hay muchos cotos de poderLa competencia es extremaBuena parte del tiempo haces trámites administrativosEl ritmo y la exigencia de la investigación científica no son buenos para la salud mentalLo más importante es publicarHay poco apoyo y recursos en nuestra región para la cienciaHay muchas

Lo que callamos los científicos

¿Por qué me gusta el formato virtual a través de la Web y la información digital? Tengo una gran lista de ventajas del formato digital entre las que repito más están: - Versatil - Personalizado - Autónomo - Dinámico - La interacción digital es continua, permanente y abierta.

Yo 💗&nbsp;digital

El pasado 25 de mayo por la mañana una de las integrantes del laboratorio,

 Delia González Marín

Curación de contenidos para enseñanza de la Biología del Color

En ciencia, una variable es un atributo, una característica o una cantidad que puede cambiar o variar en una situación, experimento o estudio.

Variables BIOcolores

Los organismos modelo para el estudio del color y la visión en los seres vivos son los que reúnen las características distintivas en alguna de sus características o fases que las posicionan como un objeto de estudio ideal para obtener nuevo conocimiento sobre fenómenos de coloración y su percepción en esta práctica se hace investigación digital multidisciplinaria y con diversas herramientas electrónicas para aprehender información sobre

Modelos para biocolores

En este blog he hablado mucho de Wikidata y sus bondades, pero todas ellas no tendrían sentido sin las consultas SPARQL que es posible generar gracias que la información está en RDF, el lenguaje semántico.

Consultas SPARQL spara wikidata

La información es poder, es uno de los bienes más democráticos, es barata y ubicua y factible de ser usada por cualquiera. La información de interés medico puede estar dirigida a distintos blancos: los médicos, el personal, los usuarios, los gestores y administradores.

BIOinformación y soluciones médicas

Estos son recursos en línea que todo profesor de ciencias, especialmente de biociencias, debiera conocer e implementar en clase usarlos facilitará dar clases dinámicas, interactivas, interesantes, activas y entretenidas, son muy versátiles porque se pueden usar para cualquier materia y para todos los temas y tienen la ventaja de que también son utilizadas en investigación, de tal manera que son útiles también para introducir a los alumnos en el

10 Recursos en línea para enseñanza de las ciencias

Las bases de datos son dinámicas, nacen, crecen se desarrollan, reproducen y mueren


Sin duda, las herramientas protagónicas de la revolución digital son tres: los dispositivos electrónicos, las computadoras y las bases de datos. Las bases de datos con información sobre biodiversidad son herramientas estratégicas e indispensables para la investigación, enseñanza, comunicación y gestión de la biodiversidad.

Las bases de datos biológicas: proyectos

Diez iniciativas de ciencia que todo investigador de biología comparada debe conocer e implementar en su práctica académica

La ciencia es dinámica, evoluciona produce novedades continuamente, muchas de esas innovaciones y mejoras tienen que ver con la propia práctica académica.

10 iniciativas para Biologia Comparada

En este blog habrá garabatos, notas, ensayos, reflexiones e ideas sobre ciencia, información, datos, conocimiento, historia, metaciencia y cualquier otra cosa interesante (o quizás no), sobre mi trabajo cotidiano, lo que pienso, lo que trabajo, algunas divagaciones y lo que me gustaría hacer, pues investigar implica principalmente pensar, reunir ideas tejerlas, entretejerlas, enmarañarlas, cortarlas y volverlas a unir, compartirlas y

Presentación

La metaciencia desempeña un papel esencial en el avance de la ciencia al proporcionar una evaluación crítica y reflexiva del proceso científico. Su contribución es fundamental para garantizar que la investigación sea confiable, transparente y ética, lo que a su vez promueve el progreso continuo del conocimiento científico.

Detectives de verificación académica

La coloración puede tener múltiples funciones biológicas y producir estrategias ecológicas que influyen en la supervivencia y el éxito reproductivo de un organismo en su entorno, estas estrategias constituyen una variable asociada a la coloración que vale la pena tener en cuenta.

Estrategias de coloración

Recuperación de información El proceso de recuperación de información académica es cíclico, inicia con la definición de la pregunta y termina con el conjunto de información recuperada, termina cuando la necesidad informacional ha sido satisfecha. En muchos casos es un proceso permanente pues los especialistas constantemente consultan información para obtener actualizaciones.

Recuperación de información sobre aposematismo

Bibliografía básica para coloración de los seres vivos

La investigación sobre la coloración en los seres vivos ha sido un área de estudio multifacética y apasionante que abarca numerosos campos de la biología, desde la genética y la fisiología hasta la ecología y la evolución.

Bibliografía básica para coloración de los seres vivos

Uno de los problemas a los que nos enfrentamos los profesores de Educación Superior en la enseñanza actual tiene que ver con el carácter fijo de los planes y programas de estudio, no solo eso, modificarlos, transformarlos, actualizarlos y modernizarlos, resulta complicado, complejo y tardado.

Implementación de las TICs en la UNAM

Es muy común que los investigadores participemos en eventos académicos como seminarios, conferencias, reuniones, congresos, talleres en los que generalmente hacemos damos una plática y usamos una presentación en formato digital.

Buenas prácticas para exposiciones científicas

Los análisis métricos de la información, también llamados bibliometría, cienciometría, infometría y altmetría se han utilizado frecuentemente para hacer investigar la historia de la ciencia desde la perspectiva de la publicación científica, este enfoque permite entender las distintas dimensión del producto científico por excelencia, los artículos científicos.

Análisis métricos para historia digital de la ciencia

La infodemia, la desinformación, la postverdad y los mitos son un desafío para la sociedad contemporánea porque la era digital ha traído consigo una revolución en la forma en que accedemos y consumimos información.

Mitos biocolores

Siempre es necesario hacer una buena revisión de la literatura cuando se va a iniciar un nuevo proyecto científico, como parte de la investigación el inicio consiste en explorar toda la literatura especializada sobre el tema, revisarla con detalle para conocer las nuevas contribuciones, reunir la literatura más relevante anotarla, porque con esas referencias se sustentará la introducción y la discusión de las publicaciones que se generarán como

Cienciometría en biociencias: 10 consideraciones para primerizos

Tesis de maestría


 Roberto Santos Solórzano

. Maestría MADEMS Biología. Protocolo para la recuperación de literatura científica digital para estudiantes de biología en el bachillerato de la UNAM. Obtención del grado 15 de noviembre del 2023.

 Ixchel Vanesa Chávez Guerrero

. Número de cuenta: 302140695. Maestría MADEMS Biología.

Equipo Bioinformación 2023

Hemos mandado una ponencia al encuentro 10° Encuentro universitario de mejores prácticas de uso de TIC en la educación educatic2024 que se llevará a cabo en modalidad híbrida del 23 al 26 de julio de 2024, este es un evento abierto al cual se puede asistir generando una cuenta en el portal

Paletas de colores bioinspiradas educatic2024

Validar la información en la web es crucial para garantizar su precisión y confiabilidad, especialmente en un entorno donde la proliferación de información puede llevar a la difusión de contenido falso o engañoso. Aquí hay algunos métodos y mejores prácticas para validar la información en línea:

 Verificar las fuentes primarias

: Buscar y verificar la información en fuentes primarias y confiables.

Validar información en la Web

Es la época de hacer listas, evaluar lo que se hizo, registrar éxitos y fracasos, aprender de los errores y disfrutar los éxitos de este año.

Recuento del 2023

CURSOS SEMESTRE 2024-2 Instituto Nacional de Ciencias Médicas y NutriciónINFORMATICA PARA LITERATURA EN CIENCIAS MÉDICAS NIVEL 1CLAVE: 68482Martes 8:00-10:00Instituto Nacional de Ciencias Médicas y NutriciónINFORMATICA PARA LITERATURA EN CIENCIAS MÉDICAS NIVEL 2CLAVE: 69761Tentativo: Miércoles 8:00-10:00. Por definir con cada alumnoProfesoresDoctora Layla Michán AguirreDoctor Israel Muñoz VelazcoMás

Cursos PCM 2024-2

Conocer y utilizar herramientas electrónicas clásicas y de vanguardia para investigación digital e importante, las herramientas electrónicas para investigación digital, también llamados recursos digitales son programas que permiten procesar datos, información, literatura y conocimiento durante el ciclo de la investigación digital.

Cajas de herramientas para investigación digital

La ciencia abierta es un movimiento nuevo, con impulso y que ha cambiado profundamente la forma de hacer ciencia, sin duda es una revolución del conocimiento, una nueva manera de hacer ciencia y una forma innovadora de implementarla.La ciencia abierta debe ser una convicción personal, una filosofía grupal, una obligación moral.

Ciencia Abierta en acción

Estas son las publicaciones que realizamos en el 2023

 Publicadas

Israel Muñoz-Velasco1 y Layla Michán.  (2023). La ciencia abierta no se dice se hace. Entrada de blog https://niboe.info/ciencia-abierta-se-hace/

 Aceptadas

González Marín, D. y Michán, L. (2024). Wikidata para enseñanza de la biología: la coloración en los felinos. Revista de Educación en Biología. Aceptada.

Publicaciones 2023

Ya está disponible la nueva versión del curso que imparto sobre

 Informática para literatura en Ciencias

Médicas del  Posgrado en Ciencias Médicas de la UNAM. Este año igual que el anterior lo dictare junto con mi colega Israel Muñoz Velasco.

Curso PCM 2025-1

Para procesar los metadatos bibliográficos mediante análisis métricos es necesario entender con detalle la estructura de la información asociada a los artículos científicos en las bases de datos, para esto resulta muy útil comprender los metadatos bibliográficos, los sistemas de organización de conocimiento utilizados para describir y clasificar los contenidos de los artículos, así como entender las especificaciones y los formatos que se

Journal Article Tag Suite (JATS)

La investigación digital tiene varias ventajas, siempre es versátil, comúnmente es multidisciplinaria, generalmente usa y promueve la ciencia abierta, es intensiva en datos, constituye una sinergia humano máquina a través de la implementación responsable y ética de la tecnología y fomenta la colaboración.

Investigación digital y colaboración

La gestión de eventos en la investigación digital es clave, continuamente tengo que asistir a actividades académicas como cursos, talleres, seminarios, conferencias, clubs de lectura. Generalmente me restrinjo a los que son en línea por videoconferencias, y me entero de ellos por medio de mis alertas de correo, RSS o por Mastodon, a algunos asisto de manera simultánea, otros los veo en video por medio de las grabaciones.

Eventos BIOinformación 2024

Una anécdota es un relato breve de un acontecimiento extraño, curioso, sorpresivo o divertido, generalmente ocurrido a la persona que lo cuenta. Haré una colección de anécdotas interesantes, divertidas o singulares, que relatan los investigadores en los textos sobre biología del color.

Anécdotas

Esta es una lista con documentos que vale la pena revisar para entender cómo fue el 2023 para la ciencia, entre estos, hay los números de revisión anuales con los descubrimientos más relevantes, los temas en boga y las selecciones imprescindibles:

La ciencia durante el 2023

Cuando publicamos en el Laboratorio Virtual de BIOinformación nos aseguramos de ser consistentes con nuestros principios, por lo tanto preferimos publicar en revistas que cumplan con los siguientes criterios: ISBNRevisión por paresDOIAcceso AbiertoSin APCQue reciba artículos en español

Criterios para seleccionar revistas para publicar

Un taxón (plural: taxones) es una unidad de clasificación utilizada en la taxonomía, que es la ciencia de clasificar y organizar los seres vivos en categorías o grupos basados en sus similitudes y relaciones evolutivas. Los taxones representan niveles jerárquicos en un sistema de clasificación biológica que va desde categorías amplias y generales hasta categorías más específicas y detalladas.

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